Die C3 Church Zurich wurde von Simon und Sara Spalinger im Januar 2012 gegründet. Die Idee dazu entstand bereits 2009, als Simon und Sara aus Australien zurückkamen. Wenige Wochen später trafen sie auf zwei Leute, die ebenfalls von einer Reise, allerdings in die Vereinigten Staaten, mit demselben Wunsch zurückkehrten. Nach einer langen Zeit der Planung, welche auch einige Besuche bei C3 in Lausanne beinhaltete, begannen sie mit dem ersten Gottesdienst am 29. Januar 2012 als ein Team von sechs Personen.

Simon Spalinger, Jahrgang 1981, ist als Missionarskind in Peru aufgewachsen, während Sara, ebenfalls Jahrgang 1981, in einem kleinen Dorf in der Nähe von Zürich gross wurde. Die beiden haben sich an der Schule kennengelernt – allerdings nicht als Schüler, sondern als Lehrer. Das Paar mit vier Kindern hat 2008 geheiratet, und nach einem Aufenthalt in Australien an der Bibelschule der C3 Church Sydney fassten die beiden den Entschluss, auch in Zürich eine solche Kirche zu gründen, weil sie hofften, dass C3 eine positive Veränderung der Stadt verursachen könnte.

Die Zürcher Gemeinde feierte ihre Gottesdienste zuerst jeweils Sonntags um 10.00 Uhr im Restaurant Au Premier am Zürcher Hauptbahnhof, heute um 10.15 Uhr  in der Bananenreiferei an der Pfingstweidstrasse 101.